Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP13Q92995 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
USP13Q92995 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms