Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SCG3Q8WXD2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SCG3Q8WXD2 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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