Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms