Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms