Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4L3Q6VB84 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms