Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms