Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATG16L1Q676U5 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms