Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms