Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms