Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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