Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE4BQ07343 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms