Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN11Q06124 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms