Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
MC1RQ01726 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MC1RQ01726 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms