Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED6P86452 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED6P86452 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ZBED6P86452 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED6P86452 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms