Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP5P82980 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP5P82980 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP5P82980 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP5P82980 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP5P82980 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP5P82980 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBP5P82980 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBP5P82980 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBP5P82980 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms