Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms