Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms