Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRHRP34981 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRHRP34981 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms