Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK11BP21127 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms