Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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PTPRAP18433 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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PTPRAP18433 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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PTPRAP18433 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRAP18433 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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