Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LRRTM2O43300 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms