Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC8A2Q9UPR5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms