Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms