Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms