Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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