Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms