Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NICN1Q9BSH3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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