Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms