Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RNFT2Q96EX2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms