Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF3C6Q969F1 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.4 ms