Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP13Q92995 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP13Q92995 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP13Q92995 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP13Q92995 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP13Q92995 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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