Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN4Q92575 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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