Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYT9Q86SS6 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms