Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC38Q502W7 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms