Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL19A1Q14993 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms