Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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TOP3AQ13472 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TOP3AQ13472 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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TOP3AQ13472 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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TOP3AQ13472 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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