Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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