Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSPB3Q12988 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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