Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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PTPN13Q12923 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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