Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTDSPL2Q05D32 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms