Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MDM2Q00987 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms