Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP5P82980 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP5P82980 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP5P82980 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms