Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HERVK_113P62684 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms