Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms