Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC025437.4-201ENST00000522975 681 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MEG8-208ENST00000553465 1176 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC009088.1-201ENST00000565152 833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 OR10AE1P-201ENST00000606962 1029 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TSN-202ENST00000409193 1436 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms