Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLCP48506 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLCP48506 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLCP48506 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLCP48506 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLCP48506 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLCP48506 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GCLCP48506 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GCLCP48506 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GCLCP48506 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLCP48506 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLCP48506 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLCP48506 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLCP48506 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLCP48506 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLCP48506 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLCP48506 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GCLCP48506 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms