Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TSACC-203ENST00000368253 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 IGKV2-28-201ENST00000482769 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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