Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms