Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBP1P32455 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBP1P32455 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBP1P32455 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms