Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms